Автор вопроса пробыла на форуме ровно 15 минут и, расстроенная, что ей не ответили, ушла спать...
Мне кажется, суть ее вопроса сводится к следующему - если она не покажет налоговикам счета-фактуры без НДС, что за это будет.
Если проверяют НДС, то ничего не будет - налоговикам должно быть всё равно, есть счета-фактуры без НДС или их вообще нет.
Если проверяют, например, налог на прибыль, то формально, счета-фактуры вообще не при чем - это первичные документы исключительно НДС. Для налога на прибыль нужны накладные, акты и т.п. Но "по жизни" счет-фактура нередко воспринимается как самый главный универсальный первичный документ, поэтому налоговики могут потребовать и те счета-фактуры, которые без НДС. Потребуют - дадите.
Вернемся к НДС. Главные налоговые регистры по НДС - книга продаж и книга покупок. Надо ли регистрировать в книге покупок счета-фактуры без НДС? Напрямую об этом нигде не сказано. Но есть, за что зацепиться. Например, пункт 8 постановления Правительства РФЫ № 914 указывает, что счета-фактуры, полученные от продавцов, подлежат регистрации в книге покупок по мере возникновения права на налоговые вычеты в порядке, установленном статьей 172 НК РФ. Поскольку по счетам-фактурам, в которых нет НДС, право на вычет не возникнет никогда, стало быть, их регистрировать в книге покупок никогда и не придется. Конечно, надо иметь в виду, что Постановление 914 доживает последние дни - оно должно быть изменено в связи с летними поправками в гл. 21.
И, тем не менее, я считаю, что регистрировать в книге покупок счета-фактуры, в которых нет НДС, не обязательно.
До 2 сентября 2010 года данная проблема вообще не имела никакого практического интереса - налог не искажен, к бухгалтерским первичным документам счета-фактуры не относятся, так что наказывать было не за что в любом случае.
Но после 2 сентября очень сильно изменились штрафы по статье 120 НК РФ, а, главное - определение "грубых ошибок". Везде по тексту этого определения к бухгалтерским документам и отчетности добавили налоговые документы и отчетность... Подробнее об изменениях читайте здесь:
Как изменятся «налоговые» штрафы Так что теперь и к налоговому учету надо относиться так же серьезно, как и к бухгалтерскому. Штраф в 10000 руб. на ровном месте теперь можно получить еще легче, чем раньше.
Успехов!